Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGY9

Slc5a7, High affinity choline transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a7Q8BGY9 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc5a7Q8BGY9 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc5a7Q8BGY9 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc5a7Q8BGY9 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc5a7Q8BGY9 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc5a7Q8BGY9 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc5a7Q8BGY9 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc5a7Q8BGY9 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc5a7Q8BGY9 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc5a7Q8BGY9 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc5a7Q8BGY9 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc5a7Q8BGY9 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc5a7Q8BGY9 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc5a7Q8BGY9 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc5a7Q8BGY9 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc5a7Q8BGY9 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc5a7Q8BGY9 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc5a7Q8BGY9 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc5a7Q8BGY9 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc5a7Q8BGY9 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc5a7Q8BGY9 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc5a7Q8BGY9 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc5a7Q8BGY9 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc5a7Q8BGY9 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc5a7Q8BGY9 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc5a7Q8BGY9 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc5a7Q8BGY9 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc5a7Q8BGY9 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc5a7Q8BGY9 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc5a7Q8BGY9 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc5a7Q8BGY9 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc5a7Q8BGY9 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc5a7Q8BGY9 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc5a7Q8BGY9 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc5a7Q8BGY9 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc5a7Q8BGY9 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc5a7Q8BGY9 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc5a7Q8BGY9 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc5a7Q8BGY9 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc5a7Q8BGY9 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc5a7Q8BGY9 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc5a7Q8BGY9 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc5a7Q8BGY9 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc5a7Q8BGY9 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc5a7Q8BGY9 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc5a7Q8BGY9 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc5a7Q8BGY9 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc5a7Q8BGY9 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc5a7Q8BGY9 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc5a7Q8BGY9 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc5a7Q8BGY9 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc5a7Q8BGY9 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc5a7Q8BGY9 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc5a7Q8BGY9 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc5a7Q8BGY9 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc5a7Q8BGY9 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc5a7Q8BGY9 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc5a7Q8BGY9 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc5a7Q8BGY9 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc5a7Q8BGY9 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Slc5a7Q8BGY9 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Slc5a7Q8BGY9 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Slc5a7Q8BGY9 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Slc5a7Q8BGY9 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Slc5a7Q8BGY9 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Slc5a7Q8BGY9 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Slc5a7Q8BGY9 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Slc5a7Q8BGY9 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Slc5a7Q8BGY9 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Slc5a7Q8BGY9 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Slc5a7Q8BGY9 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Slc5a7Q8BGY9 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Slc5a7Q8BGY9 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Slc5a7Q8BGY9 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Slc5a7Q8BGY9 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Slc5a7Q8BGY9 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Slc5a7Q8BGY9 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Slc5a7Q8BGY9 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Slc5a7Q8BGY9 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Slc5a7Q8BGY9 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Slc5a7Q8BGY9 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Slc5a7Q8BGY9 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Slc5a7Q8BGY9 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Slc5a7Q8BGY9 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Slc5a7Q8BGY9 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Slc5a7Q8BGY9 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Slc5a7Q8BGY9 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Slc5a7Q8BGY9 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Slc5a7Q8BGY9 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Slc5a7Q8BGY9 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Slc5a7Q8BGY9 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Slc5a7Q8BGY9 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Slc5a7Q8BGY9 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Slc5a7Q8BGY9 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Slc5a7Q8BGY9 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Slc5a7Q8BGY9 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Slc5a7Q8BGY9 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Slc5a7Q8BGY9 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Slc5a7Q8BGY9 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Slc5a7Q8BGY9 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms