Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Htatsf1Q8BGC0 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms