Protein–RNA interactions for Protein: Q80XK6

Atg2b, Autophagy-related protein 2 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 2,075 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2bQ80XK6 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg2bQ80XK6 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg2bQ80XK6 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg2bQ80XK6 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg2bQ80XK6 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg2bQ80XK6 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg2bQ80XK6 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg2bQ80XK6 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg2bQ80XK6 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg2bQ80XK6 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg2bQ80XK6 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg2bQ80XK6 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg2bQ80XK6 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg2bQ80XK6 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg2bQ80XK6 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg2bQ80XK6 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg2bQ80XK6 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg2bQ80XK6 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg2bQ80XK6 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg2bQ80XK6 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg2bQ80XK6 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg2bQ80XK6 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg2bQ80XK6 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg2bQ80XK6 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg2bQ80XK6 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg2bQ80XK6 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg2bQ80XK6 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg2bQ80XK6 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg2bQ80XK6 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg2bQ80XK6 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg2bQ80XK6 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg2bQ80XK6 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg2bQ80XK6 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg2bQ80XK6 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg2bQ80XK6 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg2bQ80XK6 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg2bQ80XK6 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg2bQ80XK6 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg2bQ80XK6 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg2bQ80XK6 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg2bQ80XK6 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg2bQ80XK6 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg2bQ80XK6 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg2bQ80XK6 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg2bQ80XK6 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg2bQ80XK6 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg2bQ80XK6 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg2bQ80XK6 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg2bQ80XK6 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg2bQ80XK6 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg2bQ80XK6 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg2bQ80XK6 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg2bQ80XK6 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg2bQ80XK6 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg2bQ80XK6 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg2bQ80XK6 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg2bQ80XK6 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg2bQ80XK6 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg2bQ80XK6 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg2bQ80XK6 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg2bQ80XK6 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg2bQ80XK6 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg2bQ80XK6 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Atg2bQ80XK6 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Atg2bQ80XK6 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Atg2bQ80XK6 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Atg2bQ80XK6 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Atg2bQ80XK6 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Atg2bQ80XK6 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Atg2bQ80XK6 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Atg2bQ80XK6 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Atg2bQ80XK6 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Atg2bQ80XK6 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Atg2bQ80XK6 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Atg2bQ80XK6 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Atg2bQ80XK6 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Atg2bQ80XK6 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Atg2bQ80XK6 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Atg2bQ80XK6 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Atg2bQ80XK6 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Atg2bQ80XK6 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Atg2bQ80XK6 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Atg2bQ80XK6 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Atg2bQ80XK6 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Atg2bQ80XK6 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Atg2bQ80XK6 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Atg2bQ80XK6 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Atg2bQ80XK6 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Atg2bQ80XK6 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Atg2bQ80XK6 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Atg2bQ80XK6 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Atg2bQ80XK6 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Atg2bQ80XK6 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Atg2bQ80XK6 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Atg2bQ80XK6 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Atg2bQ80XK6 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Atg2bQ80XK6 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Atg2bQ80XK6 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Atg2bQ80XK6 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Atg2bQ80XK6 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.6 ms