Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMI3

Uhrf2, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf2Q7TMI3 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Uhrf2Q7TMI3 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Uhrf2Q7TMI3 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Uhrf2Q7TMI3 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Uhrf2Q7TMI3 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
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Uhrf2Q7TMI3 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Uhrf2Q7TMI3 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Uhrf2Q7TMI3 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Uhrf2Q7TMI3 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Uhrf2Q7TMI3 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
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Uhrf2Q7TMI3 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Uhrf2Q7TMI3 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Uhrf2Q7TMI3 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Uhrf2Q7TMI3 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Uhrf2Q7TMI3 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Uhrf2Q7TMI3 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Uhrf2Q7TMI3 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
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