Protein–RNA interactions for Protein: Q78S06

Sys1, Protein SYS1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sys1Q78S06 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Sys1Q78S06 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sys1Q78S06 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sys1Q78S06 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sys1Q78S06 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Sys1Q78S06 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Sys1Q78S06 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sys1Q78S06 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sys1Q78S06 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sys1Q78S06 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Sys1Q78S06 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sys1Q78S06 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sys1Q78S06 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Sys1Q78S06 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sys1Q78S06 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Sys1Q78S06 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Sys1Q78S06 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sys1Q78S06 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sys1Q78S06 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sys1Q78S06 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Sys1Q78S06 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Sys1Q78S06 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Sys1Q78S06 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Sys1Q78S06 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sys1Q78S06 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Sys1Q78S06 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sys1Q78S06 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sys1Q78S06 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Sys1Q78S06 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sys1Q78S06 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sys1Q78S06 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sys1Q78S06 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sys1Q78S06 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sys1Q78S06 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sys1Q78S06 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sys1Q78S06 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Sys1Q78S06 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sys1Q78S06 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sys1Q78S06 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sys1Q78S06 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sys1Q78S06 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sys1Q78S06 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sys1Q78S06 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Sys1Q78S06 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Sys1Q78S06 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Sys1Q78S06 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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