Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
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Ccdc88cQ6VGS5 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Ccdc88cQ6VGS5 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Ccdc88cQ6VGS5 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Ccdc88cQ6VGS5 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Ccdc88cQ6VGS5 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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