Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zbtb40Q6PCS8 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Zbtb40Q6PCS8 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zbtb40Q6PCS8 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Zbtb40Q6PCS8 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Zbtb40Q6PCS8 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Zbtb40Q6PCS8 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Zbtb40Q6PCS8 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Zbtb40Q6PCS8 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Zbtb40Q6PCS8 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Zbtb40Q6PCS8 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Zbtb40Q6PCS8 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zbtb40Q6PCS8 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zbtb40Q6PCS8 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zbtb40Q6PCS8 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zbtb40Q6PCS8 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zbtb40Q6PCS8 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zbtb40Q6PCS8 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zbtb40Q6PCS8 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zbtb40Q6PCS8 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zbtb40Q6PCS8 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zbtb40Q6PCS8 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zbtb40Q6PCS8 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zbtb40Q6PCS8 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zbtb40Q6PCS8 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zbtb40Q6PCS8 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zbtb40Q6PCS8 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Zbtb40Q6PCS8 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zbtb40Q6PCS8 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Zbtb40Q6PCS8 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Zbtb40Q6PCS8 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zbtb40Q6PCS8 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Zbtb40Q6PCS8 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zbtb40Q6PCS8 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zbtb40Q6PCS8 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zbtb40Q6PCS8 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zbtb40Q6PCS8 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Zbtb40Q6PCS8 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zbtb40Q6PCS8 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Zbtb40Q6PCS8 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Zbtb40Q6PCS8 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Zbtb40Q6PCS8 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Zbtb40Q6PCS8 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Zbtb40Q6PCS8 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Zbtb40Q6PCS8 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Zbtb40Q6PCS8 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Zbtb40Q6PCS8 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zbtb40Q6PCS8 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Zbtb40Q6PCS8 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Zbtb40Q6PCS8 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Zbtb40Q6PCS8 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zbtb40Q6PCS8 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zbtb40Q6PCS8 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Zbtb40Q6PCS8 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Zbtb40Q6PCS8 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Zbtb40Q6PCS8 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Zbtb40Q6PCS8 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zbtb40Q6PCS8 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zbtb40Q6PCS8 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Zbtb40Q6PCS8 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Zbtb40Q6PCS8 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zbtb40Q6PCS8 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zbtb40Q6PCS8 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Zbtb40Q6PCS8 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Zbtb40Q6PCS8 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zbtb40Q6PCS8 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zbtb40Q6PCS8 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zbtb40Q6PCS8 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zbtb40Q6PCS8 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zbtb40Q6PCS8 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zbtb40Q6PCS8 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zbtb40Q6PCS8 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zbtb40Q6PCS8 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zbtb40Q6PCS8 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zbtb40Q6PCS8 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zbtb40Q6PCS8 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Zbtb40Q6PCS8 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zbtb40Q6PCS8 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Zbtb40Q6PCS8 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zbtb40Q6PCS8 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zbtb40Q6PCS8 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Zbtb40Q6PCS8 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Zbtb40Q6PCS8 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Zbtb40Q6PCS8 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Zbtb40Q6PCS8 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zbtb40Q6PCS8 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zbtb40Q6PCS8 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Zbtb40Q6PCS8 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Zbtb40Q6PCS8 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Zbtb40Q6PCS8 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Zbtb40Q6PCS8 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zbtb40Q6PCS8 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Zbtb40Q6PCS8 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Zbtb40Q6PCS8 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zbtb40Q6PCS8 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zbtb40Q6PCS8 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Zbtb40Q6PCS8 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zbtb40Q6PCS8 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zbtb40Q6PCS8 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Zbtb40Q6PCS8 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms