Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Foxd4Q60688 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Foxd4Q60688 Olfr202-203ENSMUST00000217485 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Foxd4Q60688 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Foxd4Q60688 BB218582-201ENSMUST00000123623 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Foxd4Q60688 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Foxd4Q60688 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Foxd4Q60688 Gm15809-201ENSMUST00000159361 661 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Foxd4Q60688 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Foxd4Q60688 Milr1-207ENSMUST00000182908 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Foxd4Q60688 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Foxd4Q60688 Pou1f1-205ENSMUST00000184525 1020 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Foxd4Q60688 6030460B20Rik-201ENSMUST00000191764 1058 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Foxd4Q60688 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Foxd4Q60688 Gm42783-201ENSMUST00000197075 795 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Foxd4Q60688 AC164624.1-201ENSMUST00000219148 1025 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Foxd4Q60688 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Foxd4Q60688 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Foxd4Q60688 Wfdc12-201ENSMUST00000051272 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Foxd4Q60688 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Foxd4Q60688 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Foxd4Q60688 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Foxd4Q60688 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Foxd4Q60688 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Foxd4Q60688 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Foxd4Q60688 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Foxd4Q60688 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Foxd4Q60688 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Foxd4Q60688 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Foxd4Q60688 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Foxd4Q60688 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Foxd4Q60688 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Foxd4Q60688 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Foxd4Q60688 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Foxd4Q60688 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Foxd4Q60688 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Foxd4Q60688 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Foxd4Q60688 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Foxd4Q60688 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Foxd4Q60688 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Foxd4Q60688 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Foxd4Q60688 9630028H03Rik-202ENSMUST00000153402 1559 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Foxd4Q60688 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Foxd4Q60688 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Foxd4Q60688 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Foxd4Q60688 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Foxd4Q60688 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Foxd4Q60688 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Foxd4Q60688 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Foxd4Q60688 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Foxd4Q60688 Prl8a8-202ENSMUST00000110350 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Foxd4Q60688 Vmn1r-ps92-201ENSMUST00000120775 517 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Foxd4Q60688 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Foxd4Q60688 1700057H21Rik-201ENSMUST00000152467 383 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Foxd4Q60688 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Foxd4Q60688 4930445B16Rik-201ENSMUST00000170085 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Foxd4Q60688 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Foxd4Q60688 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Foxd4Q60688 4930440C22Rik-202ENSMUST00000190754 512 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Foxd4Q60688 Gm43491-201ENSMUST00000197133 784 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Foxd4Q60688 Zfp799-202ENSMUST00000201499 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Foxd4Q60688 4930480M12Rik-201ENSMUST00000221084 550 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Foxd4Q60688 AC154515.3-201ENSMUST00000225081 1159 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Foxd4Q60688 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Foxd4Q60688 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Foxd4Q60688 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Foxd4Q60688 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Foxd4Q60688 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Foxd4Q60688 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Foxd4Q60688 Olfr183-204ENSMUST00000214831 1906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Foxd4Q60688 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Foxd4Q60688 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Foxd4Q60688 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Foxd4Q60688 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Foxd4Q60688 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Foxd4Q60688 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Foxd4Q60688 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Foxd4Q60688 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Foxd4Q60688 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Foxd4Q60688 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Foxd4Q60688 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Foxd4Q60688 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Foxd4Q60688 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Foxd4Q60688 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Foxd4Q60688 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Foxd4Q60688 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Foxd4Q60688 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Foxd4Q60688 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Foxd4Q60688 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Foxd4Q60688 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Foxd4Q60688 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Foxd4Q60688 Selenof-202ENSMUST00000106211 1178 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Foxd4Q60688 Serpina3a-202ENSMUST00000109965 1204 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Foxd4Q60688 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Foxd4Q60688 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Foxd4Q60688 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Foxd4Q60688 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Foxd4Q60688 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Foxd4Q60688 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Foxd4Q60688 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms