Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI3

Rnf123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf123Q5XPI3 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf123Q5XPI3 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf123Q5XPI3 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf123Q5XPI3 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf123Q5XPI3 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf123Q5XPI3 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf123Q5XPI3 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf123Q5XPI3 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf123Q5XPI3 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf123Q5XPI3 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf123Q5XPI3 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf123Q5XPI3 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf123Q5XPI3 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf123Q5XPI3 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf123Q5XPI3 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf123Q5XPI3 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf123Q5XPI3 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf123Q5XPI3 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf123Q5XPI3 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf123Q5XPI3 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf123Q5XPI3 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf123Q5XPI3 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf123Q5XPI3 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf123Q5XPI3 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf123Q5XPI3 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf123Q5XPI3 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf123Q5XPI3 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf123Q5XPI3 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf123Q5XPI3 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf123Q5XPI3 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf123Q5XPI3 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf123Q5XPI3 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf123Q5XPI3 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf123Q5XPI3 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf123Q5XPI3 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf123Q5XPI3 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf123Q5XPI3 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf123Q5XPI3 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf123Q5XPI3 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf123Q5XPI3 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf123Q5XPI3 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf123Q5XPI3 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf123Q5XPI3 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf123Q5XPI3 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf123Q5XPI3 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf123Q5XPI3 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf123Q5XPI3 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf123Q5XPI3 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf123Q5XPI3 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf123Q5XPI3 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf123Q5XPI3 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf123Q5XPI3 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf123Q5XPI3 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf123Q5XPI3 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf123Q5XPI3 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf123Q5XPI3 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf123Q5XPI3 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf123Q5XPI3 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf123Q5XPI3 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf123Q5XPI3 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf123Q5XPI3 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf123Q5XPI3 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf123Q5XPI3 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf123Q5XPI3 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf123Q5XPI3 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf123Q5XPI3 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf123Q5XPI3 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf123Q5XPI3 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf123Q5XPI3 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf123Q5XPI3 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf123Q5XPI3 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf123Q5XPI3 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf123Q5XPI3 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf123Q5XPI3 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf123Q5XPI3 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf123Q5XPI3 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf123Q5XPI3 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf123Q5XPI3 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf123Q5XPI3 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf123Q5XPI3 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf123Q5XPI3 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf123Q5XPI3 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf123Q5XPI3 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf123Q5XPI3 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf123Q5XPI3 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf123Q5XPI3 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf123Q5XPI3 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf123Q5XPI3 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf123Q5XPI3 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf123Q5XPI3 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf123Q5XPI3 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf123Q5XPI3 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf123Q5XPI3 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf123Q5XPI3 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf123Q5XPI3 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf123Q5XPI3 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf123Q5XPI3 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf123Q5XPI3 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf123Q5XPI3 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf123Q5XPI3 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms