Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

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Length 803 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Tsr1Q5SWD9 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Tsr1Q5SWD9 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Tsr1Q5SWD9 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Tsr1Q5SWD9 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Tsr1Q5SWD9 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Tsr1Q5SWD9 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Tsr1Q5SWD9 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Tsr1Q5SWD9 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Tsr1Q5SWD9 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Tsr1Q5SWD9 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Tsr1Q5SWD9 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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