Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUD9

Bbs12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbs12Q5SUD9 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Bbs12Q5SUD9 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Bbs12Q5SUD9 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms