Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
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Trappc1Q5NCF2 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
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Trappc1Q5NCF2 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Rassf2-201ENSMUST00000028814 8233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Adgrl3-217ENSMUST00000121707 6690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
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Trappc1Q5NCF2 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
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Trappc1Q5NCF2 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC8.78□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC8.78□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
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Trappc1Q5NCF2 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
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Trappc1Q5NCF2 Tti2-201ENSMUST00000098842 5039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
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Trappc1Q5NCF2 Myh11-201ENSMUST00000090287 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
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Trappc1Q5NCF2 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
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Trappc1Q5NCF2 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
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Trappc1Q5NCF2 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
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Trappc1Q5NCF2 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
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