Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim58Q5NCC9 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim58Q5NCC9 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim58Q5NCC9 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms