Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Gm2030-201ENSMUST00000119590 1129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Gm15225-201ENSMUST00000120449 1017 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 1700023C21Rik-201ENSMUST00000143247 389 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Gm28054-201ENSMUST00000187280 872 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Olfr489-ps1-201ENSMUST00000210404 967 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 CT010480.1-201ENSMUST00000223612 363 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Cts3-202ENSMUST00000223815 1367 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Znf48Q3US17 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Gm11491-201ENSMUST00000129441 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 2810404M03Rik-201ENSMUST00000188324 1245 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Gm20177-201ENSMUST00000203705 334 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 AC118750.1-201ENSMUST00000214163 675 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Ermard-209ENSMUST00000226561 1019 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Pmis2-201ENSMUST00000051495 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
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