Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms