Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms