Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Rnf149Q3U2C5 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf149Q3U2C5 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf149Q3U2C5 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf149Q3U2C5 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Rnf149Q3U2C5 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf149Q3U2C5 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf149Q3U2C5 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Rnf149Q3U2C5 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Rnf149Q3U2C5 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Rnf149Q3U2C5 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
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Rnf149Q3U2C5 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Rnf149Q3U2C5 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Rnf149Q3U2C5 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Rnf149Q3U2C5 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf149Q3U2C5 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Rnf149Q3U2C5 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Rnf149Q3U2C5 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Rnf149Q3U2C5 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnf149Q3U2C5 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Rnf149Q3U2C5 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnf149Q3U2C5 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnf149Q3U2C5 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Rnf149Q3U2C5 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Rnf149Q3U2C5 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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