Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1D9

UPF0602 protein C4orf47 homolog, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U1D9 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q3U1D9 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Q3U1D9 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Q3U1D9 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Q3U1D9 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q3U1D9 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q3U1D9 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Q3U1D9 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q3U1D9 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q3U1D9 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q3U1D9 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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