Protein–RNA interactions for Protein: Q3TR08

Fndc4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc4Q3TR08 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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