Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp2b3Q0VF55 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp2b3Q0VF55 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp2b3Q0VF55 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp2b3Q0VF55 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp2b3Q0VF55 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp2b3Q0VF55 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp2b3Q0VF55 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp2b3Q0VF55 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp2b3Q0VF55 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp2b3Q0VF55 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp2b3Q0VF55 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp2b3Q0VF55 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp2b3Q0VF55 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp2b3Q0VF55 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp2b3Q0VF55 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp2b3Q0VF55 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp2b3Q0VF55 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp2b3Q0VF55 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp2b3Q0VF55 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp2b3Q0VF55 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp2b3Q0VF55 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp2b3Q0VF55 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp2b3Q0VF55 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp2b3Q0VF55 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp2b3Q0VF55 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp2b3Q0VF55 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp2b3Q0VF55 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp2b3Q0VF55 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp2b3Q0VF55 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp2b3Q0VF55 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp2b3Q0VF55 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp2b3Q0VF55 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp2b3Q0VF55 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp2b3Q0VF55 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp2b3Q0VF55 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp2b3Q0VF55 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp2b3Q0VF55 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp2b3Q0VF55 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp2b3Q0VF55 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp2b3Q0VF55 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp2b3Q0VF55 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp2b3Q0VF55 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp2b3Q0VF55 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp2b3Q0VF55 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp2b3Q0VF55 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp2b3Q0VF55 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp2b3Q0VF55 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp2b3Q0VF55 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp2b3Q0VF55 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp2b3Q0VF55 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp2b3Q0VF55 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp2b3Q0VF55 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp2b3Q0VF55 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp2b3Q0VF55 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp2b3Q0VF55 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp2b3Q0VF55 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp2b3Q0VF55 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp2b3Q0VF55 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp2b3Q0VF55 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp2b3Q0VF55 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp2b3Q0VF55 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp2b3Q0VF55 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp2b3Q0VF55 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp2b3Q0VF55 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp2b3Q0VF55 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp2b3Q0VF55 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp2b3Q0VF55 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp2b3Q0VF55 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp2b3Q0VF55 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp2b3Q0VF55 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atp2b3Q0VF55 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atp2b3Q0VF55 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atp2b3Q0VF55 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atp2b3Q0VF55 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atp2b3Q0VF55 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atp2b3Q0VF55 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atp2b3Q0VF55 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atp2b3Q0VF55 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atp2b3Q0VF55 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atp2b3Q0VF55 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atp2b3Q0VF55 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atp2b3Q0VF55 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atp2b3Q0VF55 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atp2b3Q0VF55 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atp2b3Q0VF55 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atp2b3Q0VF55 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atp2b3Q0VF55 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atp2b3Q0VF55 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Atp2b3Q0VF55 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Atp2b3Q0VF55 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Atp2b3Q0VF55 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atp2b3Q0VF55 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Atp2b3Q0VF55 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atp2b3Q0VF55 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atp2b3Q0VF55 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atp2b3Q0VF55 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atp2b3Q0VF55 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atp2b3Q0VF55 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atp2b3Q0VF55 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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