Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Gm6092-201ENSMUST00000121659 2029 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Olfr1495-203ENSMUST00000216980 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms