Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms