Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms