Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.3 ms