Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Gm15036-201ENSMUST00000118880 400 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms