Protein–RNA interactions for Protein: P97459

Npas1, Neuronal PAS domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas1P97459 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Npas1P97459 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Npas1P97459 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Npas1P97459 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Npas1P97459 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Npas1P97459 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Npas1P97459 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Npas1P97459 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Npas1P97459 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Npas1P97459 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Npas1P97459 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Npas1P97459 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Npas1P97459 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Npas1P97459 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Npas1P97459 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Npas1P97459 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Npas1P97459 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Npas1P97459 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Npas1P97459 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Npas1P97459 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Npas1P97459 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Npas1P97459 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Npas1P97459 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Npas1P97459 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Npas1P97459 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Npas1P97459 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Npas1P97459 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Zcchc7-203ENSMUST00000107824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Npas1P97459 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Npas1P97459 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Npas1P97459 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Npas1P97459 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Npas1P97459 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Npas1P97459 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Npas1P97459 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Npas1P97459 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Npas1P97459 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms