Protein–RNA interactions for Protein: P60335

Pcbp1, Poly(rC)-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp1P60335 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pcbp1P60335 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pcbp1P60335 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pcbp1P60335 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pcbp1P60335 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pcbp1P60335 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pcbp1P60335 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pcbp1P60335 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pcbp1P60335 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pcbp1P60335 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pcbp1P60335 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pcbp1P60335 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pcbp1P60335 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pcbp1P60335 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pcbp1P60335 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pcbp1P60335 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pcbp1P60335 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pcbp1P60335 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pcbp1P60335 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pcbp1P60335 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pcbp1P60335 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pcbp1P60335 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pcbp1P60335 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pcbp1P60335 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pcbp1P60335 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pcbp1P60335 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pcbp1P60335 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pcbp1P60335 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pcbp1P60335 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pcbp1P60335 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pcbp1P60335 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pcbp1P60335 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pcbp1P60335 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pcbp1P60335 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pcbp1P60335 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pcbp1P60335 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pcbp1P60335 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pcbp1P60335 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pcbp1P60335 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pcbp1P60335 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pcbp1P60335 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pcbp1P60335 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pcbp1P60335 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pcbp1P60335 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pcbp1P60335 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pcbp1P60335 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pcbp1P60335 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pcbp1P60335 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pcbp1P60335 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pcbp1P60335 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pcbp1P60335 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pcbp1P60335 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pcbp1P60335 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pcbp1P60335 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pcbp1P60335 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pcbp1P60335 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pcbp1P60335 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pcbp1P60335 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pcbp1P60335 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pcbp1P60335 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Pcbp1P60335 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pcbp1P60335 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pcbp1P60335 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pcbp1P60335 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pcbp1P60335 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pcbp1P60335 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pcbp1P60335 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Pcbp1P60335 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pcbp1P60335 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pcbp1P60335 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pcbp1P60335 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Pcbp1P60335 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pcbp1P60335 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pcbp1P60335 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pcbp1P60335 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pcbp1P60335 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pcbp1P60335 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pcbp1P60335 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pcbp1P60335 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pcbp1P60335 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pcbp1P60335 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pcbp1P60335 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pcbp1P60335 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pcbp1P60335 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pcbp1P60335 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pcbp1P60335 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pcbp1P60335 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pcbp1P60335 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pcbp1P60335 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pcbp1P60335 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pcbp1P60335 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pcbp1P60335 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pcbp1P60335 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pcbp1P60335 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pcbp1P60335 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pcbp1P60335 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pcbp1P60335 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pcbp1P60335 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pcbp1P60335 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pcbp1P60335 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms