Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Gm12752-201ENSMUST00000121657 811 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Rbm48-202ENSMUST00000121877 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Gm12249-201ENSMUST00000132323 719 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LtbrP50284 C730036E19Rik-201ENSMUST00000188305 1102 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LtbrP50284 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LtbrP50284 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
LtbrP50284 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Gm43222-201ENSMUST00000199013 603 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LtbrP50284 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
LtbrP50284 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
LtbrP50284 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LtbrP50284 4930555F03Rik-201ENSMUST00000033963 717 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LtbrP50284 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LtbrP50284 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Gm5656-201ENSMUST00000171020 1096 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LtbrP50284 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LtbrP50284 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Sult1e1-201ENSMUST00000031201 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LtbrP50284 2310061N02Rik-201ENSMUST00000050882 794 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms