Protein–RNA interactions for Protein: P48030

Tgfa, Protransforming growth factor alpha, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfaP48030 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TgfaP48030 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
TgfaP48030 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TgfaP48030 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TgfaP48030 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TgfaP48030 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TgfaP48030 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TgfaP48030 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TgfaP48030 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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