Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gli1P47806 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gli1P47806 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gli1P47806 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gli1P47806 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gli1P47806 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gli1P47806 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gli1P47806 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gli1P47806 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gli1P47806 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gli1P47806 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
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