Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LtbP41155 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LtbP41155 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LtbP41155 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LtbP41155 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LtbP41155 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LtbP41155 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LtbP41155 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LtbP41155 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LtbP41155 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LtbP41155 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LtbP41155 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LtbP41155 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LtbP41155 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LtbP41155 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LtbP41155 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LtbP41155 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LtbP41155 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LtbP41155 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LtbP41155 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LtbP41155 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LtbP41155 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LtbP41155 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LtbP41155 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LtbP41155 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LtbP41155 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LtbP41155 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LtbP41155 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LtbP41155 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
LtbP41155 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LtbP41155 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LtbP41155 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LtbP41155 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LtbP41155 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LtbP41155 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LtbP41155 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LtbP41155 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LtbP41155 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
LtbP41155 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
LtbP41155 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
LtbP41155 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LtbP41155 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LtbP41155 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LtbP41155 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LtbP41155 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
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LtbP41155 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
LtbP41155 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
LtbP41155 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LtbP41155 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LtbP41155 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LtbP41155 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LtbP41155 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LtbP41155 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LtbP41155 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LtbP41155 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LtbP41155 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LtbP41155 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LtbP41155 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LtbP41155 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
LtbP41155 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LtbP41155 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LtbP41155 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LtbP41155 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LtbP41155 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LtbP41155 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LtbP41155 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LtbP41155 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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LtbP41155 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LtbP41155 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LtbP41155 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LtbP41155 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LtbP41155 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LtbP41155 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LtbP41155 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LtbP41155 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LtbP41155 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LtbP41155 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LtbP41155 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LtbP41155 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LtbP41155 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LtbP41155 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LtbP41155 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LtbP41155 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LtbP41155 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
LtbP41155 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LtbP41155 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LtbP41155 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LtbP41155 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
LtbP41155 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LtbP41155 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LtbP41155 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LtbP41155 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LtbP41155 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LtbP41155 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LtbP41155 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
LtbP41155 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
LtbP41155 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms