Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.3 ms