Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eif3aP23116 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eif3aP23116 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eif3aP23116 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eif3aP23116 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eif3aP23116 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eif3aP23116 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eif3aP23116 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eif3aP23116 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Eif3aP23116 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eif3aP23116 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Eif3aP23116 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eif3aP23116 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eif3aP23116 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eif3aP23116 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eif3aP23116 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eif3aP23116 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eif3aP23116 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eif3aP23116 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Eif3aP23116 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Eif3aP23116 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Eif3aP23116 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eif3aP23116 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eif3aP23116 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eif3aP23116 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eif3aP23116 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eif3aP23116 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eif3aP23116 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eif3aP23116 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eif3aP23116 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eif3aP23116 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eif3aP23116 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eif3aP23116 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eif3aP23116 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eif3aP23116 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eif3aP23116 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eif3aP23116 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eif3aP23116 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eif3aP23116 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eif3aP23116 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eif3aP23116 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eif3aP23116 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eif3aP23116 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eif3aP23116 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eif3aP23116 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eif3aP23116 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eif3aP23116 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eif3aP23116 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eif3aP23116 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Eif3aP23116 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eif3aP23116 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Eif3aP23116 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Eif3aP23116 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eif3aP23116 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Eif3aP23116 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eif3aP23116 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eif3aP23116 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eif3aP23116 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eif3aP23116 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eif3aP23116 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eif3aP23116 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Eif3aP23116 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Eif3aP23116 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Eif3aP23116 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Eif3aP23116 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Eif3aP23116 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Eif3aP23116 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Eif3aP23116 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Eif3aP23116 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Eif3aP23116 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Eif3aP23116 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Eif3aP23116 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Eif3aP23116 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Eif3aP23116 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Eif3aP23116 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Eif3aP23116 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Eif3aP23116 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Eif3aP23116 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Eif3aP23116 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Eif3aP23116 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Eif3aP23116 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Eif3aP23116 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Eif3aP23116 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Eif3aP23116 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Eif3aP23116 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Eif3aP23116 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Eif3aP23116 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Eif3aP23116 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Eif3aP23116 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Eif3aP23116 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Eif3aP23116 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Eif3aP23116 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eif3aP23116 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eif3aP23116 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Eif3aP23116 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eif3aP23116 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eif3aP23116 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eif3aP23116 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eif3aP23116 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eif3aP23116 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms