Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
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