Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
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H2-Eb1P04230 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
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