Protein–RNA interactions for Protein: O70258

Sgce, Epsilon-sarcoglycan, mousemouse

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Length 437 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgceO70258 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SgceO70258 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SgceO70258 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SgceO70258 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SgceO70258 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SgceO70258 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SgceO70258 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SgceO70258 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SgceO70258 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SgceO70258 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SgceO70258 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SgceO70258 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SgceO70258 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SgceO70258 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SgceO70258 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SgceO70258 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SgceO70258 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SgceO70258 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SgceO70258 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SgceO70258 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SgceO70258 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SgceO70258 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SgceO70258 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SgceO70258 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SgceO70258 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SgceO70258 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SgceO70258 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SgceO70258 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SgceO70258 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SgceO70258 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SgceO70258 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SgceO70258 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SgceO70258 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SgceO70258 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SgceO70258 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SgceO70258 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SgceO70258 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SgceO70258 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SgceO70258 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SgceO70258 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SgceO70258 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SgceO70258 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SgceO70258 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SgceO70258 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SgceO70258 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SgceO70258 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SgceO70258 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SgceO70258 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SgceO70258 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SgceO70258 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SgceO70258 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SgceO70258 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SgceO70258 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SgceO70258 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SgceO70258 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SgceO70258 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SgceO70258 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SgceO70258 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SgceO70258 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SgceO70258 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SgceO70258 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SgceO70258 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SgceO70258 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SgceO70258 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SgceO70258 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SgceO70258 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SgceO70258 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SgceO70258 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SgceO70258 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SgceO70258 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SgceO70258 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SgceO70258 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SgceO70258 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SgceO70258 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SgceO70258 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SgceO70258 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SgceO70258 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SgceO70258 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SgceO70258 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SgceO70258 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SgceO70258 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SgceO70258 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SgceO70258 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SgceO70258 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SgceO70258 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SgceO70258 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SgceO70258 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SgceO70258 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SgceO70258 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SgceO70258 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SgceO70258 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SgceO70258 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SgceO70258 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SgceO70258 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SgceO70258 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SgceO70258 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SgceO70258 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SgceO70258 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SgceO70258 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SgceO70258 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms