Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
E2f6O54917 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
E2f6O54917 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
E2f6O54917 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
E2f6O54917 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
E2f6O54917 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
E2f6O54917 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
E2f6O54917 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
E2f6O54917 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
E2f6O54917 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
E2f6O54917 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
E2f6O54917 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
E2f6O54917 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
E2f6O54917 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms