Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
DffaO54786 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
DffaO54786 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
DffaO54786 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
DffaO54786 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
DffaO54786 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
DffaO54786 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
DffaO54786 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
DffaO54786 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
DffaO54786 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
DffaO54786 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
DffaO54786 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
DffaO54786 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
DffaO54786 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
DffaO54786 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
DffaO54786 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
DffaO54786 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
DffaO54786 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
DffaO54786 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
DffaO54786 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
DffaO54786 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
DffaO54786 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
DffaO54786 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
DffaO54786 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
DffaO54786 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
DffaO54786 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
DffaO54786 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
DffaO54786 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
DffaO54786 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
DffaO54786 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
DffaO54786 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
DffaO54786 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
DffaO54786 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
DffaO54786 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
DffaO54786 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
DffaO54786 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
DffaO54786 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
DffaO54786 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
DffaO54786 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DffaO54786 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DffaO54786 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DffaO54786 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
DffaO54786 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
DffaO54786 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
DffaO54786 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
DffaO54786 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
DffaO54786 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
DffaO54786 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
DffaO54786 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
DffaO54786 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DffaO54786 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
DffaO54786 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DffaO54786 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
DffaO54786 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DffaO54786 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
DffaO54786 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
DffaO54786 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
DffaO54786 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DffaO54786 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
DffaO54786 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
DffaO54786 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DffaO54786 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
DffaO54786 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
DffaO54786 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
DffaO54786 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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DffaO54786 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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DffaO54786 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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DffaO54786 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DffaO54786 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DffaO54786 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
DffaO54786 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DffaO54786 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
DffaO54786 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DffaO54786 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DffaO54786 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DffaO54786 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
DffaO54786 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
DffaO54786 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DffaO54786 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DffaO54786 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DffaO54786 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DffaO54786 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DffaO54786 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
DffaO54786 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
DffaO54786 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
DffaO54786 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
DffaO54786 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
DffaO54786 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
DffaO54786 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
DffaO54786 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
DffaO54786 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
DffaO54786 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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