Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
CrxO54751 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
CrxO54751 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
CrxO54751 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
CrxO54751 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
CrxO54751 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
CrxO54751 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
CrxO54751 Cspg4-201ENSMUST00000035661 8121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
CrxO54751 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
CrxO54751 Nrap-202ENSMUST00000073536 5501 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
CrxO54751 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
CrxO54751 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
CrxO54751 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
CrxO54751 Map4-204ENSMUST00000164930 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
CrxO54751 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
CrxO54751 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
CrxO54751 Rel-201ENSMUST00000102864 7466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
CrxO54751 Bcl2l11-205ENSMUST00000110341 5036 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
CrxO54751 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
CrxO54751 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
CrxO54751 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
CrxO54751 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
CrxO54751 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
CrxO54751 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
CrxO54751 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
CrxO54751 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC8.88□□□□□ -0.99
CrxO54751 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
CrxO54751 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
CrxO54751 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
CrxO54751 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
CrxO54751 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
CrxO54751 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
CrxO54751 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC8.88□□□□□ -0.99
CrxO54751 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
CrxO54751 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
CrxO54751 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
CrxO54751 Ctsl-205ENSMUST00000222517 6168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
CrxO54751 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
CrxO54751 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
CrxO54751 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
CrxO54751 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
CrxO54751 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
CrxO54751 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
CrxO54751 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
CrxO54751 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
CrxO54751 Trpm1-201ENSMUST00000085222 5711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
CrxO54751 Ank1-215ENSMUST00000173248 7100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
CrxO54751 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
CrxO54751 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
CrxO54751 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
CrxO54751 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
CrxO54751 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
CrxO54751 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
CrxO54751 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
CrxO54751 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
CrxO54751 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
CrxO54751 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
CrxO54751 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
CrxO54751 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
CrxO54751 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
CrxO54751 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
CrxO54751 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
CrxO54751 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
CrxO54751 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
CrxO54751 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
CrxO54751 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
CrxO54751 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
CrxO54751 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
CrxO54751 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
CrxO54751 9330175E14Rik-201ENSMUST00000180445 4852 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
CrxO54751 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
CrxO54751 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
CrxO54751 Nlgn1-205ENSMUST00000193603 11807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
CrxO54751 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC8.88□□□□□ -0.99
CrxO54751 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
CrxO54751 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
CrxO54751 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
CrxO54751 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
CrxO54751 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
CrxO54751 Greb1-201ENSMUST00000048064 7940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
CrxO54751 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
CrxO54751 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
CrxO54751 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
CrxO54751 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
CrxO54751 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
CrxO54751 Disp1-201ENSMUST00000003035 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
CrxO54751 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
CrxO54751 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
CrxO54751 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
CrxO54751 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
CrxO54751 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
CrxO54751 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
CrxO54751 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
CrxO54751 Myo6-201ENSMUST00000035889 7871 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
CrxO54751 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
CrxO54751 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
CrxO54751 Usp45-201ENSMUST00000040429 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
CrxO54751 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
CrxO54751 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
CrxO54751 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms