Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

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Length 966 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkd2O35245 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkd2O35245 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkd2O35245 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkd2O35245 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkd2O35245 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkd2O35245 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkd2O35245 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkd2O35245 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkd2O35245 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkd2O35245 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkd2O35245 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkd2O35245 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkd2O35245 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkd2O35245 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkd2O35245 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkd2O35245 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkd2O35245 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkd2O35245 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkd2O35245 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkd2O35245 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkd2O35245 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkd2O35245 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkd2O35245 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkd2O35245 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkd2O35245 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkd2O35245 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkd2O35245 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkd2O35245 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkd2O35245 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkd2O35245 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkd2O35245 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkd2O35245 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkd2O35245 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkd2O35245 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkd2O35245 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkd2O35245 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkd2O35245 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkd2O35245 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkd2O35245 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkd2O35245 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkd2O35245 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkd2O35245 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkd2O35245 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
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Pkd2O35245 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkd2O35245 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkd2O35245 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkd2O35245 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkd2O35245 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkd2O35245 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkd2O35245 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkd2O35245 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkd2O35245 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkd2O35245 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkd2O35245 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkd2O35245 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkd2O35245 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkd2O35245 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkd2O35245 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkd2O35245 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkd2O35245 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkd2O35245 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkd2O35245 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkd2O35245 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkd2O35245 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkd2O35245 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkd2O35245 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkd2O35245 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkd2O35245 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkd2O35245 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkd2O35245 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkd2O35245 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkd2O35245 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkd2O35245 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkd2O35245 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkd2O35245 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkd2O35245 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkd2O35245 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkd2O35245 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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Pkd2O35245 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkd2O35245 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkd2O35245 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkd2O35245 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkd2O35245 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkd2O35245 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkd2O35245 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkd2O35245 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkd2O35245 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkd2O35245 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkd2O35245 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkd2O35245 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkd2O35245 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkd2O35245 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkd2O35245 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkd2O35245 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkd2O35245 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkd2O35245 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkd2O35245 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
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