Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms