Protein–RNA interactions for Protein: O08686

Barx2, Homeobox protein BarH-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx2O08686 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Barx2O08686 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Barx2O08686 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Barx2O08686 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Barx2O08686 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Barx2O08686 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Barx2O08686 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Barx2O08686 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Barx2O08686 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Barx2O08686 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Barx2O08686 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Barx2O08686 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Barx2O08686 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Barx2O08686 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Barx2O08686 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Barx2O08686 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Barx2O08686 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Barx2O08686 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Barx2O08686 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Barx2O08686 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Barx2O08686 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Barx2O08686 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Barx2O08686 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Barx2O08686 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Barx2O08686 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Barx2O08686 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Barx2O08686 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Barx2O08686 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Barx2O08686 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Barx2O08686 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Barx2O08686 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Barx2O08686 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Barx2O08686 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Barx2O08686 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Barx2O08686 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Barx2O08686 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Barx2O08686 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Barx2O08686 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Barx2O08686 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Barx2O08686 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Barx2O08686 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Barx2O08686 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Barx2O08686 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Barx2O08686 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Barx2O08686 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Barx2O08686 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Barx2O08686 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Barx2O08686 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Barx2O08686 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Barx2O08686 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Barx2O08686 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Barx2O08686 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Barx2O08686 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Barx2O08686 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Barx2O08686 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Barx2O08686 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Barx2O08686 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Barx2O08686 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Barx2O08686 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Barx2O08686 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Barx2O08686 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Barx2O08686 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Barx2O08686 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Barx2O08686 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Barx2O08686 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Barx2O08686 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Barx2O08686 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Barx2O08686 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Barx2O08686 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Barx2O08686 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Barx2O08686 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Barx2O08686 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Barx2O08686 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Barx2O08686 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Barx2O08686 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Barx2O08686 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Barx2O08686 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Barx2O08686 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Barx2O08686 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Barx2O08686 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Barx2O08686 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Barx2O08686 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Barx2O08686 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Barx2O08686 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Barx2O08686 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Barx2O08686 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Barx2O08686 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Barx2O08686 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Barx2O08686 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Barx2O08686 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Barx2O08686 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Barx2O08686 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Barx2O08686 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Barx2O08686 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Barx2O08686 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Barx2O08686 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Barx2O08686 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Barx2O08686 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Barx2O08686 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Barx2O08686 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms