Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm2035J3QP87 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm2035J3QP87 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm2035J3QP87 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm2035J3QP87 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm2035J3QP87 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm2035J3QP87 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
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Gm2035J3QP87 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm2035J3QP87 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm2035J3QP87 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm2035J3QP87 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm2035J3QP87 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Gm2035J3QP87 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm2035J3QP87 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm2035J3QP87 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm2035J3QP87 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Gm2035J3QP87 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm2035J3QP87 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm2035J3QP87 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm2035J3QP87 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm2035J3QP87 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm2035J3QP87 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm2035J3QP87 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm2035J3QP87 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm2035J3QP87 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm2035J3QP87 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm2035J3QP87 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm2035J3QP87 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm2035J3QP87 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm2035J3QP87 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Gm2035J3QP87 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm2035J3QP87 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Gm2035J3QP87 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Gm2035J3QP87 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm2035J3QP87 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm2035J3QP87 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Gm2035J3QP87 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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