Protein–RNA interactions for Protein: F7C9A1

Gm3327, Predicted gene 3327 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3327F7C9A1 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm3327F7C9A1 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm3327F7C9A1 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm3327F7C9A1 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3327F7C9A1 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3327F7C9A1 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3327F7C9A1 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3327F7C9A1 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3327F7C9A1 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3327F7C9A1 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3327F7C9A1 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3327F7C9A1 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3327F7C9A1 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3327F7C9A1 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3327F7C9A1 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3327F7C9A1 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3327F7C9A1 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3327F7C9A1 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3327F7C9A1 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3327F7C9A1 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3327F7C9A1 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3327F7C9A1 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3327F7C9A1 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3327F7C9A1 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3327F7C9A1 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3327F7C9A1 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3327F7C9A1 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3327F7C9A1 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3327F7C9A1 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3327F7C9A1 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3327F7C9A1 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3327F7C9A1 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3327F7C9A1 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3327F7C9A1 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3327F7C9A1 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3327F7C9A1 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3327F7C9A1 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3327F7C9A1 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3327F7C9A1 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3327F7C9A1 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3327F7C9A1 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3327F7C9A1 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3327F7C9A1 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3327F7C9A1 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3327F7C9A1 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3327F7C9A1 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3327F7C9A1 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3327F7C9A1 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3327F7C9A1 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3327F7C9A1 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3327F7C9A1 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3327F7C9A1 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3327F7C9A1 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3327F7C9A1 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3327F7C9A1 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3327F7C9A1 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3327F7C9A1 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3327F7C9A1 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3327F7C9A1 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3327F7C9A1 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3327F7C9A1 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3327F7C9A1 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3327F7C9A1 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3327F7C9A1 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3327F7C9A1 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3327F7C9A1 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3327F7C9A1 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3327F7C9A1 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3327F7C9A1 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3327F7C9A1 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3327F7C9A1 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3327F7C9A1 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3327F7C9A1 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3327F7C9A1 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3327F7C9A1 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3327F7C9A1 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3327F7C9A1 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3327F7C9A1 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3327F7C9A1 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3327F7C9A1 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3327F7C9A1 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3327F7C9A1 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3327F7C9A1 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3327F7C9A1 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3327F7C9A1 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3327F7C9A1 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3327F7C9A1 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3327F7C9A1 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3327F7C9A1 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3327F7C9A1 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3327F7C9A1 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3327F7C9A1 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3327F7C9A1 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3327F7C9A1 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3327F7C9A1 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3327F7C9A1 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3327F7C9A1 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3327F7C9A1 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3327F7C9A1 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3327F7C9A1 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms