Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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