Protein–RNA interactions for Protein: E9Q623

BC051665, cDNA sequence BC051665, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC051665E9Q623 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
BC051665E9Q623 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
BC051665E9Q623 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
BC051665E9Q623 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
BC051665E9Q623 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
BC051665E9Q623 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
BC051665E9Q623 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
BC051665E9Q623 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
BC051665E9Q623 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
BC051665E9Q623 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
BC051665E9Q623 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
BC051665E9Q623 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
BC051665E9Q623 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
BC051665E9Q623 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
BC051665E9Q623 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
BC051665E9Q623 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC12□□□□□ -0.49
BC051665E9Q623 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
BC051665E9Q623 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
BC051665E9Q623 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
BC051665E9Q623 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
BC051665E9Q623 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
BC051665E9Q623 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC12□□□□□ -0.49
BC051665E9Q623 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC12□□□□□ -0.49
BC051665E9Q623 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC12□□□□□ -0.49
BC051665E9Q623 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC12□□□□□ -0.49
BC051665E9Q623 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
BC051665E9Q623 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
BC051665E9Q623 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
BC051665E9Q623 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC12□□□□□ -0.49
BC051665E9Q623 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
BC051665E9Q623 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC12□□□□□ -0.49
BC051665E9Q623 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC12□□□□□ -0.49
BC051665E9Q623 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC12□□□□□ -0.49
BC051665E9Q623 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
BC051665E9Q623 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC12□□□□□ -0.49
BC051665E9Q623 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC12□□□□□ -0.49
BC051665E9Q623 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC12□□□□□ -0.49
BC051665E9Q623 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
BC051665E9Q623 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC12□□□□□ -0.49
BC051665E9Q623 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
BC051665E9Q623 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
BC051665E9Q623 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
BC051665E9Q623 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
BC051665E9Q623 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
BC051665E9Q623 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
BC051665E9Q623 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
BC051665E9Q623 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
BC051665E9Q623 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
BC051665E9Q623 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC12□□□□□ -0.49
BC051665E9Q623 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
BC051665E9Q623 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
BC051665E9Q623 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
BC051665E9Q623 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
BC051665E9Q623 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
BC051665E9Q623 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
BC051665E9Q623 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
BC051665E9Q623 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
BC051665E9Q623 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
BC051665E9Q623 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
BC051665E9Q623 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
BC051665E9Q623 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
BC051665E9Q623 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
BC051665E9Q623 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
BC051665E9Q623 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
BC051665E9Q623 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
BC051665E9Q623 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
BC051665E9Q623 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
BC051665E9Q623 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
BC051665E9Q623 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
BC051665E9Q623 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
BC051665E9Q623 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
BC051665E9Q623 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
BC051665E9Q623 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
BC051665E9Q623 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
BC051665E9Q623 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
BC051665E9Q623 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
BC051665E9Q623 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
BC051665E9Q623 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
BC051665E9Q623 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
BC051665E9Q623 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
BC051665E9Q623 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
BC051665E9Q623 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
BC051665E9Q623 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
BC051665E9Q623 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
BC051665E9Q623 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
BC051665E9Q623 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
BC051665E9Q623 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
BC051665E9Q623 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
BC051665E9Q623 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
BC051665E9Q623 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
BC051665E9Q623 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
BC051665E9Q623 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
BC051665E9Q623 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
BC051665E9Q623 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
BC051665E9Q623 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
BC051665E9Q623 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
BC051665E9Q623 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
BC051665E9Q623 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
BC051665E9Q623 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
BC051665E9Q623 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms