Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6W3

Rdh8, Retinol dehydrogenase 8, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh8D3Z6W3 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms