Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Prss55-201ENSMUST00000089338 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Gm12906-201ENSMUST00000154610 441 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Gm29763-201ENSMUST00000205306 616 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Gm2696-202ENSMUST00000220393 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Zfp961-203ENSMUST00000132848 781 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Gm23576-201ENSMUST00000179918 110 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Lemd1-201ENSMUST00000112357 964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Gm5700-201ENSMUST00000191483 989 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 1810013D15Rik-201ENSMUST00000029827 300 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms