Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

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Length 197 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
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Rd3lB2RV38 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
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Rd3lB2RV38 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
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Rd3lB2RV38 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Rd3lB2RV38 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Rd3lB2RV38 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Rd3lB2RV38 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Rd3lB2RV38 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Rd3lB2RV38 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms