Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms